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国内医院的HIS建设从上世纪80年代初开始，虽然发展道路曲折，存在各种各样的问题，取得的成就也是有目共睹的。卫生部最近的抽样调查显示，在国内近17000家县以上医院中，有31%的医院已经建设了HIS系统。
在20年的发展中，国内HIS建设经历了以下三种模式：医院自己开发软件（或与人合作开发）、医院请人开发软件和医院购买商品化软件。
现在，国内医院HIS建设普遍采用购买商品化软件的模式，1994年以来，全国至少有5000多家医院通过这种模式建设了自己的HIS系统。
三大矛盾
但购买商品化软件也存在很多问题，归纳起来主要有以下三大矛盾：
1. HIS是产品还是工程？
国内HIS经过多年的发展，HIS公司总希望把HIS做成“通用”产品，希望能满足“所有”医院的需求，尽量不做客户化修改或者少修改。因此对于大型HIS系统而言，任何修改都非常困难，不但影响系统的稳定性，还会延长实施周期，增加成本。对于医院来说，总是希望HIS公司能按照医院的管理模式开发、修改软件，尽量满足医院现行的管理模式，希望HIS按工程来做。
这是一对永远的矛盾，问题之一。
2. 医院在HIS建设中到底应扮演什么角色？永远是被动接受者吗？
医院与HIS公司签了合同，但医院并不真正了解软件，公司也不真正了解医院的需求。于是，需要经过需求调研、修改、安装、培训、使用的过程。结果却是：再修改、完善、扯皮、协调，没完没了。医院永远是等待者、接受者、配合者，永远是被动的。
永远被动，问题之二。
3. 软件与服务，哪个更重要？
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